赤峰博物馆的镇馆之宝是红山文化C型玉龙。这件玉龙代表了红山文化，是赤峰文化的象征，并且有着几千年的历史。不幸的是，原件被中国国家博物馆借走并且至今未归还，所以目前博物馆内展出的是它的复制品。
除了玉龙，赤峰博物馆还有其他珍贵的馆藏，如：
红山文化勾云形玉佩
红山文化石雕人像
赵宝沟文化凤型陶杯
夏家店下层文化彩绘陶鬲
西汉王莽铸钱陶范
辽代三彩鸳鸯壶
清代金丝楠木骨灰罐
清代金字《甘珠尔经》
这些都是赤峰博物馆的馆藏精品
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